I relativt ursprunglig miljö påträffas bergdunört på frisk eller fuktig mulljord i lundartad löv- och blandskog, särskilt i steniga sluttningar, i bergbranter och rasmarker samt kring hällar. Man ser den ofta i bryn, på åkerholmar och åkerrenar. Den utvecklas bäst på lätt beskuggade lokaler men ses ändå ofta öppet och torrt på kulturmark, t.ex. på gårdsplaner, i grustag och på skräpmark. Man finner den även i åkerkanter och trädgårdsland.