Kärrliljan växer i Norden endast i kalkkällmyrar på Gotland. Från Småland finns två icke trovärdiga uppgifter. Dels finns ett herbarieex från ´Sm. mosse N om Ryssby´ 1931 (J. Johansson i LD). Samlaren etiketterade om sitt herbarium på ålderns höst varvid många fel uppstod. Dels noterades arten vid skogsvårdsstyrelsens nyckelbiotopsinventering från Vetlanda Karlstorp Sällevadsåns dalgång 2,5 km S Kvarnefors (Å. Eckerbom enligt P. Karlsson 1996). Biotopen var en östvänd bergbrant (!). Även jordviva Primula vulgaris och torta Cicerbita alpina noterades från området.