Mälarfräne är en hybrid mellan vattenfräne R. amphibia och strandfräne R. sylvestris; den uppträder främst i områden där föräldrarna spontant växer tillsammans. Den är inte känd från Småland. Belägg med namnet Nasturtium amphibium × silvestre, insamlade i Växjö Växjö av A. S. Trolander och C. Pleijel, är enligt Jonsell (1968) snarare vägfräne R. ×armoracioides. – Westerlund (1852b) och Sjöstrand (1863) påstod att Nasturtium anceps skulle finnas här och där i trakten av Kalmar Kalmar, men utan belägg är det omöjligt att veta vad som avsågs. Under 1800-talet användes nämligen epitetet anceps i vidare mening än nu.