Krustistel bedöms ursprunglig på tångvallar vid havet, obetade steniga stränder och fågelöar, miljöer där den idag är ovanlig. I stället växer den främst på kväverik, öppen mark och gynnas av mänskliga aktiviteter i odlingslandskapet. Krustistel ses ofta i skräpmarker som jordhögar, stentippar, komposter och grustäkter. Växten är vanlig i gårdsmiljöer och vägrenar. Ibland ses den i betade hässlen eller kvävepåverkade betesmarker och den gynnas när röjningar eller grävningar sker. Som åkerogräs bedöms den ha minskat även om den än idag är funnen i kanten av extensivt skötta åkrar och på trädor.

Krustistel är vanlig i nära anslutning till Ölands många byar. På Stora Alvaret saknas den men har dykt upp när träddungar huggits bort. Norr om Borgholm är fynden lite glesare men växten är funnen i alla socknar. Ökad näringstillgång i landskapet har gynnat krustistel.

Gammal, bofast.