Bägarkrokus härstammar från Balkan och vidare österut till Turkiet. Den är populär i odling, speciellt ofta planterad under de senaste decennierna och många kultivarer har tagits fram. Bägarkrokus hittas främst i vägkanter, kulturpåverkad gräsmark nära trädgårdar och på utkastplatser. Den sprider sig ganska lätt och på några ställen är den rapporterad från "naturlig" vegetation som torrängar och stenbrott på gränsen till Stora Alvaret. På en lokal, ett hästbetat och stenigt hässle vid avtaget till ödebyn Hildeborg, Torslunda sn, förefaller arten vara bofast. De flesta fynd är gjorda söder om Borgholm, nära västra respektive östra landsvägen.

Kulturflykting, bofast.