Kärrsälting växer i allehanda våta miljöer som fuktängar, skogskärr, alvarträsk, vätar och källflöden; den ses både på betade och ohävdade lokaler. Kärrsälting växer också vid diken, vattenhål, dammar, i gamla stenbrott och sandtag. På havsstränder föredrar den sötvattensutflöde och ses ibland sida vid sida med havssälting T. maritima.

Kärrsälting finns spridd över större delen av Öland, speciellt frekvent inom södra halvan av Mittlandet med dess stora våtmarksområden. Växten är också vanlig på Stora Alvaret och i östra sjömarken. Som väntat är den obefintlig i Bödas barrskogar. Kärrsälting förefaller klara sig bra på dagens Öland.

Gammal, bofast.