Hårmöja har i Sverige en nordlig utbredning med enstaka fynd så långt söderut som i Småland. Den späda växten förekommer i sötvatten på hårdbottnar i kalkrika men näringsfattiga vatten samt i brackvatten där den klarar en salthalt på 3 ‰. Det finns några äldre fynd med belägg från Öland. Thomas Karlsson har granskat fyra av dem och funnit att det rör sig om småblommiga former av grodmöja R. trichophyllus. I Jonsell (2001) finns inte hårmöja upptagen från Öland. Ett sent taget belägg från 1998 har inte gått att granska.