Stubbtåg är ursprunglig på havsstränder, strandängar, vid källflöden och i alvarvätar. På dagens Öland är den vanlig på kulturpåverkade lokaler som betade frisk- och fuktängar, traktorvägar samt ruderatmarker med jordhögar. Stubbtåg växer även i stenbrott, åkerkanter, utmed diken, kanaler och dammar. Den klarar även extremt kalkrika lokaler och är noterad vid något tillfälle i grusalvar.

Stubbtåg är en vanlig växt och spridd över större delen av Öland. Endast barrskogarna i Böda och Högby sn har glest med fynd. På Stora Alvaret växer stubbtåg mest vid vattenhål för djuren och i fuktiga traktorspår. I östra sjömarken är många lokaler belägna alldeles i strandlinjen.

Stubbtåg kan förväxlas med salttåg J. gerardii som den ibland delar växtplatser med. Hos stubbtåg är ståndarknappen 1–2 gånger så lång som ståndarsträngen; kapseln är tydligt längre än kalkbladen. Hos salttåg är ståndarknappen 2–4 gånger så lång som strängen; kapseln är jämnhög med kalkbladen.

Gammal, bofast.