Väggört härstammar från södra Mellaneuropa och Sydeuropa men har gamla anor som odlad medicinalväxt i norra Mellaneuropa och i Danmark, där den räknas till de ´levende fortidsminder´ (Faurholdt & Løjtnant 1990). I Sverige förekommer väggörten på några platser i sydligaste Sverige men är nog av yngre datum. Den växer på näringsrik öppen jord, helst i lätt skugga och inte alltför torrt. – I Oskarshamn Oskarshamn har den spritt sig med frö till komposter och öppen jord i några trädgårdar från ett exemplar som inplanterades 1958. Detta hämtades från Simrishamn i Skåne, varifrån arten är känd sedan gammalt.

Väggört betecknas som starkt hotad på den svenska rödlistan (Gärdenfors 2005). Den småländska, sent etablerade förekomsten kanske inte har högsta skyddsvärde.