Bäckveronika växer på våt eller fuktig, näringsrik, oftast lerig jord, så gott som alltid i anslutning till rörligt vatten. Den förekommer vid källor, på genomsilad mark samt vid bäckar och andra sötvattensstränder. Arten påträffas också i ängar, lövkärr och sumpskog, särskilt med al. I kulturmiljö växer den i diken, på dammkanter och i sänkor i betesmark.
Funnen i 514 rutor; tidigare uppgifter från 153 rutor. Vanlig i norra Småland, ganska vanlig i södra och sydvästra delen av höglandet, i resten av landskapet ganska sällsynt (i öster) till sällsynt (i väster). – Ursprunglig.