Träjon är särskilt vanlig på kulturmark: vid block och hällar, kring rösen, längs stenmurar och markvägar, på åkerholmar och i bryn. Arten förekommer dessutom i gles, blockig skog av olika slag, från mullrika lövskog till hälltallskog, kanske ibland kvarstående från en tid när markerna var mera öppna. Den påträffas också i bäckdalar och rasbranter. Vid kusten kan man finna den ända ute på småskären.
Arten odlas ibland som prydnadsväxt.