Skelört växer företrädesvis i näringsrik, öppen jord där förna och mull anhopats, gärna i skuggiga lägen. I Smålands magrare trakter är arten sällsynt och helt bunden till kväverik jord vid gårdar, kring ladugårdar och uthus. I bördigare områden växer den även i bynära hagmark och gårdsdungar, gärna i blocksamlingar, på kullar med lind, i stenrösen och gamla myrstackar. I norra Småland kan man även påträffa den i rasbranter och lövrika raviner långt från bebyggelse.

Arten hade tidigare stort anseende som läkeväxt; det är möjligt att den från början är medvetet införd till landet. Om arten har odlats i Småland måste det dock ligga långt tillbaka i tiden; vi har inga källor som antyder detta.