Nässelsnärja delas upp i två underarter: vanlig nässelsnärja subsp. europaea och strandsnärja subsp. halophyta. Kanske är det endast ståndorten som skiljer dem åt? Någon skiljekaraktär förutom växtplatsen har vi inte kunnat fastslå under inventeringen. Enligt tillgängliga floror ska vanlig nässelsnärja ha en stjälk som är gulaktig och fyrtaliga blommor medan strandsnärja har en mörkröd stjälk och femtaliga blommor. Det stämmer ibland men inte alltid. De fynd som gjorts på havsstränder redovisas under strandsnärja.