Bockrot företräds på Öland av två underarter: vanlig bockrot subsp. saxifraga och sammetsbockrot subsp. nigra. Sammetsbockrot skiljs på behåringen av stjälk och bladskaft där håren är längre och sitter betydligt tätare än hos vanlig bockrot. Bladen är dessutom mer fintandade hos sammetsbockrot. Yttersta delen av roten (epidermis) är mörkbrun–svart och när roten snittas blånar den snabbt och tydligt. Den blåa färgen kommer av att ämnet proazulen oxideras när roten kommer i kontakt med luftens syre. Hos vanlig bockrot är epidermis ljusbrun och roten blånar inte i snitt. Antalet kromosomer skiljer: subsp. saxifraga 2n = 36, 40 och subsp. nigra 2n = 18, 20 (Jonsell & Karlsson 2010).

Se även sammetsbockrot Pimpinella saxifraga subsp. nigra och vanlig bockrot Pimpinella saxifraga subsp. saxifraga