Rotfibbla växer på torr, sandig–grusig och något kalkfattig mark. Den är troligen ursprunglig i glesare skogar med tall eller björk, på sandiga–steniga stränder och dyner. Idag är den främst funnen på kulturpåverkade lokaler som betade torrängar och sandgräshedar, slitna gräsmattor, grusvägar, åkerkanter och trädor, gamla sandtag och grusplaner. Rotfibbla är vanlig i ruderatmiljöer med tippade sandhögar.

Rotfibbla är främst funnen i de västra socknarna Räpplinge och söderut till Smedby. Sandiga områden i de östra socknarna Bredsättra och söderut till Sandby hyser också en del förekomster. Liksom andra arter som är knutna till sand är den ovanlig på sydöstra Öland. En sträcka på ett par mil norr om Borgholm har idag liksom förr en svårförklarlig utbredningslucka. Rotfibbla har ökat något jämfört med Sterner (1938). Den gynnas av åtgärder i odlingslandskapet som röjningar av betesmarker och skogar samt tillskapande av grusiga ytor på parkeringar och liknande miljöer. Jämfört med Sterner (1938) ses en antydd ökning i statistiska analyser (Telfer).

Gammal, bofast.