Flenört växer på måttligt torr till fuktig mulljord. Den trivs bäst på skuggiga eller halvskuggiga platser men kan växa i full sol. I naturlig omgivning påträffas den i örtrik löv- och blandskog, på berghyllor, i lövbranter och ravinkanter samt längs bäck- och åstränder, men väl så ofta finner man den i starkt kulturpåverkad omgivning: rösen, åkerrenar, diken, gårdskanter och industritomter.
Arten växer för det mesta enstaka, men där kväve frigjorts efter röjning och kalhuggning uppträder den ofta i stora bestånd.
Funnen i 1382 rutor; tidigare uppgifter från 224 rutor. Mycket vanlig. – Ursprunglig.