Sumpfräne är en konkurrenssvag art som växer på bar, fuktig, näringsrik mark. Till skillnad från övriga småländska fränen är den ettårig och saknar förmåga till vegetativ spridning. Å andra sidan är fruktsättningen alltid god. Den finns på dy- eller sandblandad jord på stränder, både vid havet och vid sötvatten; i skärgården förekommer den ibland i fågelgödslade hällkar. Men framför allt växer arten vid vattenhål och diken, på gödslade och hårt trampade betesmarker, på sidlänta åkrar, jordhögar och skräpmark. Ibland påträffas den som trädgårdsogräs.
Funnen i 914 rutor; tidigare uppgifter från 147 rutor. Ojämnt spridd. Ganska vanlig i de flesta trakter men med lägre frekvens i längst i nordväst och i det östra fattigområdet. – Ursprunglig (men starkt kulturgynnad).