Flenört är ursprunglig på steniga havsstränder och i glesare skogar, ofta av lundkaraktär. Men majoriteten av dagens lokaler kan betecknas som diverse skräpmarker: jord- och stentippar, gamla stenbrott samt grävda vattenhål och bevattningsdammar. Flenört ses även i grusiga vägkanter, helst när de löper genom skogar. Ibland växer den längs diken, i åkerkanter och betesmarker. Vid ett tillfälle är den funnen i alvarkarst.

Flenört är vanlig på Öland men undviker nästan helt Stora Alvaret. För övrigt växer den spritt över större delen av ön. Den gynnas av en ökad näringstillgång i landskapet samt mänskliga aktiviteter som när betesmarker röjs, skogsvägar dras fram eller dammar grävs.

Gammal, bofast.