Klostergemsrot anses ursprunglig i västra och centrala Europas bergstrakter. Den är sällsynt i odling och påträffas i vägkanter och som utkast. På primärlokalen i Köping sn växer den på en ödetomt och har spridit sig ut i omgivande tallskog. Den är mer skuggtålig än de andra arterna i släktet. Klostergemsrot får anses bofast i landskapet med tanke på hur länge den hållit sig kvar på primärlokalen och dessutom visar växten där spridningstendenser.

Klostergemsrot skiljs på att basalbladen är hjärtlika med en mycket smal inskärning, hela plantan är påtagligt hårig. Blomningen infaller sent i jämförelse med de andra i släktet, andra halvan av maj till mitten av juni.

Kulturflykting, bofast.