Blå bolltistel härstammar från sydöstra Europa. Den förekommer i odling liksom släktingen bolltistel E. sphaerocephalus. Blå bolltistel är främst tillfällig i ruderatmiljöer som sten- och jordhögar samt trädgårdstippar. Den kan även växa i vägrenar, åkerkanter, gamla grustag och vara spridd i skogsdungar där trädgårdsavfall tippats. Till skillnad från bolltistel har den inte på samma sätt naturaliserats på klapperstensvallar vid havet. Blå bolltistel bedöms ändå vara bofast då den hållit sig kvar på primärlokalen i nästan 30 år.

Blå bolltistel är främst funnen nära större tätorter på mellersta delen av västra Öland. För övrigt är fynden spridda och växten fåtalig på sina lokaler. En tydlig expansion har skett under de senaste decennierna.

Kulturflykting, bofast.