Ursprunglig.
Öppen, torr till frisk, kalkrik miljö: kalkhällmark, torrängar, gles hällmarkstallskog, fårbetesmark, strandängar och grustag. Någon gång i kalkfuktängar, på bleke och i vägrenar. Kortbladig spåtistel växer ofta rikligt på öppen strandklapper och torr grusmark. Den har en tydligt kustbunden utbredning, särskilt framträdande på västra sidan, från Klinte till Fårö. Troligen var detta tidigare den vanligaste underarten; i dag är gränserna mellan underarterna inte så tydliga.