Myggblomster är flerårig. Växten har en kort upprät jordstam och anlägger varje år en ny näringslagrande knöl vid basen av stängeln. Den kan föröka sig vegetativt med små groddknoppar i bladkanterna. De små fröna är vindspridda. Myggblomster är en konkurrenssvag myrväxt knuten till öppna blöta fattigkärr. Arten är troligen oberoende av kalk eller möjligen något kalkskyende. Den klarar dock inte att växa i mossar och undviker de mest extrema fattigkärren. Troligen gynnas arten av en något förhöjd näringshalt men missgynnas när vegetationen blir för tät och snabbväxande. Även utan stråväxter måste myggblomstret växa tillräckligt för att inte bli övervuxen av vitmossor. Gungflyn eller lösbottenmosaiker med gles lågvuxen vegetation och inslag av öppna vattensamlingar är därför typiska växtplatser för myggblomster. Även laggkärr och magrare delar av översvämningsbetingade mader är vanliga. Ofta sitter plantan »löst nedstucken« i vitmossan, ibland direkt i dyn mellan strån och blad.