Bäckbräsman är flerårig och kan spridas vegetativt med krypande, rotslående utlöpare från basen av stjälken. Den är beroende av rörligt framträngande grundvatten och hittas i huvudsak vid rikare källor och källbäckar. Den trivs inte i miljöer med stillastående och surt markvatten och gynnas därför av kalk- och lerrika jordar. Arten kan dock vara rotad i olika jordar – torv, sten, sand, lera och lös dy har noterats. Bäckbräsman kan växa nästan helt öppet i källor, i myrar eller i odlingslandskapet, men oftare mer eller mindre skuggigt i skogen. Typiska miljöer är bäckstråk eller starkt genomsilade sluttningar och raviner med ormbunkar, kärrfibbla och andra örter. Arten förekommer även i lundmiljöer vid orörda åar och bäckar utan synligt grundvattenutflöde. Den växer också i skogs- och åkerdiken på ställen som troligen påverkas av framträngande grundvatten. Arten har inte noterats på havsstränder eller i kulturskapade miljöer. Bäckbräsman är en bra signalart för värdefulla skogsmiljöer och nästan alltid ett bevis på rörligt ytnära grundvatten. Den förekommer ibland i massvegetation.

Bäckbräsman är påtagligt ojämnt spridd. I många delar av landskapet är den sällsynt. Den saknas helt i skärgården.
Vanlig (42% och 191 noterade lokaler).