Hästskräppan är flerårig. Fröna har lång flytbarhet (1 månad–1 år) och växten är i huvudsak vattenspridd. Hästskräppan växer vid näringsrika sjöar, vattendrag och utsötade havsvikar. Typiska miljöer är fuktängar vid rinnande vatten och strandvassar. Den hävdar sig väl mot högvuxna strandväxter och kan stå i täta vassar av starr eller vass. Arten växer öppet och gärna i anslutning till odlad mark. Den är näringsgynnad och kulturgynnad och förekommer även vid strandnära diken och ibland på dikesmassor. På några lokaler förekommer arten i stor mängd, särskilt längs Syltbäcken vid Kungsgården i Ovansjö.

Sällsynt (10 % och 43 lokaler). Ökande.