Gårdsskräppan växer på öppen mark i kulturlandskapet. Den föredrar mullrik jord och är mycket vanlig i anslutning till odlad mark. Den växer som ogräs i odlingar, längs diken, vid ladugårdar, i ohävdade gårdsmiljöer och skräpgräsmarker. Arten bildar fröbank och kan förekomma i stor mängd på trädesåkrar, konstbetesmarker och vallodlingar där den ofta blir ett svårbemästrat ogräs. Gårdsskräppan följer kulturen lite varstans och förekommer också längs vägkanter, i tät-orter, på industritomter, soptippar och fyllnadsmassor.

Arten är jämnt spridd över landskapet utom längs kusten där den inte är lika vanlig.
Mycket vanlig (98% och 508 noterade lokaler).

hybrider
Hybriden med tomtskräppa, R longifolius × obtusifolius, finns belagd från Gävle: Tegelhagen [Stadsträdgården] 1837 och 1841 (herb Hartman i UPS, !S Murbeck) samt 1872 och 1877 (RHn & F Almqvist i S, !S Snogerup), vid ån nedom ångbryggeriet i nya stadsdelen (RHn enl Arnell 1924b). Den har också noterats i Furuviksparken i Valbo (LEr).