Bitterpilört är ursprunglig men kulturgynnad. I någorlunda naturlig vegetation är den funnen på mineraljordsstränder och i alkärr. De vanligaste växtplatserna finns emellertid på fuktig, kulturpåverkad mark - vid märgelhålor och dammar, utmed vattendrag och diken genom betes- och åkermarker samt på stigar, åkervägar och i åkerkanter.