Bergkorsört är ursprunglig men mycket kulturgynnad. I någorlunda naturlig vegetation finner man den på sandhedar vid havet och i klippterrang. Den ettåriga, konkurrenssvaga och kvävegynnade arten är särskilt vanlig på hyggen, där den inte sällan uppträder i massförekomst de första åren efter avverkningen. I övrigt ser man den ofta på skogsvägar, vägkanter och vägslänter i skogstrakter samt i grustag och på ruderatmark.

Bergkorsort verkar ha ökat under 1900-talet, sannolikt gynnad av nutidens skogsbruk med talrika kalhyggen och skogsbilvägar.