Nord- och Mellaneuropa. I Sverige nästan hela landet, norrut sällsyntare. I Sörmland tämligen allmän och jämnt spridd men sparsam i Mälarområdet – (38%). Backdunörten är en karaktärsart för bergrötter och fuktiga klippbranter med sippervatten. Den trivs såväl i vattenförande lodsprickor som på nordexponerade strandhällar vid något näringsrika sjöar, där bergytorna översköljs av stänk och vågskvalp. Den är också vanlig på klipphyllor i både sol- och skuggläge, ofta i vägskärningarnas branter.