Europa, Asien, Nordamerika. I Sverige nästan hela landet. I Sörmland tämligen allmän, jämnt spridd – (36%). Krustisteln är tvåårig och växer helst på bar, kväverik mark vid gårdar eller intill bebyggelsen i tätorter, exempelvis på tomter, bakgårdar, jordhögar, tippar eller på banvallar. Den växer också på åsbackar i Mälarområdet samt sällsynt även på insjöstränder. Krustisteln har blivit vanligare under 1900-talet.