Småfingerörten är flerårig och växer i lågväxt, gärna kortbetad örtrik torr gräsmark. Arten bildar ofta täta mattor på moränbackarnas och gravhögarnas sydsidor. Den är kalkgynnad och på fastlandet ersätter den vårfingerörten i kalkbergens klippängar.

Småfingerörten är troligen helt apomiktisk och sätter frö utan befruktning. Den ingår i ett artkomplex som varierar bl.a. i hårighetens utbildning. Plantor med starkt assymmetriska stjärnhår på bladundersidan har ansetts höra till P. × subarenaria – grå småfingerört. Denna var tidigare endast känd från sydöstra Sverige. I Sörmland har individ med stjärnhår identifierats främst i den östra delen men också i Mälarområdet. Den har inte eftersökts under inventeringen och är därför mycket förbisedd.