Skogsknipproten växer i örtrika skogar, både granskogar och lundar, vanligen öppna, men ibland mycket skuggiga som i slutna hässlen. Arten är tydligt kalkgynnad och växer gärna i bryn och på störd jord utefter skogsvägkanter, oftast fåtalig. Arten fanns troligen förr i slåtterängar eller deras utkanter. Den missgynnas starkt av bete och blir ofta avbetad av rådjur.