Europa. I Sverige i Götalands och Svealands slättbygder. I Sörmland tämligen allmän vid Mälaren, Hjälmaren och i sjösystemen i centrala delen. Saknas nästan helt i skogsbygden och kustområdet – (22%). Vattenskräppan är flerårig och växer på stränder av näringsrika sjöar och åar, vanligen i vasszonen, ibland vid utsötade havsvikar. Där vattenskräppa och hästskräppa växer tillsammans hittar man sällsynt, särskilt vid Mälaren, storskräppa, som är hybriden mellan de två arterna – (rapporterad från 33 rutor).