Europa, Nordafrika, Asien, Nordamerika. I Sverige upp till Gästrikland, men med ojämn frekvens. I Sörmland mindre allmän, vanligare i de östra delarna – (9%). Luddunörten växer på solöppen mark, vid bäckar, kring källor och i diken med rörligt vatten, särskilt i områden med kalkrika lerjordar. Någon gång kan arten uppträda på fuktig kulturmark, exempelvis i trädgårdsland.