Trubbhagtorn är ursprunglig men också odlad och förvildad. De vanligaste växtplatserna är hävdade eller igenväxande naturbetesmarker med lövdungar och snår. Ofta ingår berghällar och rösen i biotopen. Den växer också utmed bäck- och åstränder, kring märgelhålor, i lövbryn samt på åker- och vägrenar.