Knärot växer i mossig äldre barrskog, vanligen med linnea och grönpyrola och även ryl. Den förekommer även i blåbärsgranskog och ibland i mer örtrika barrskogar och i produktiv skog på torvmark. Ibland växer den på mossiga block. Knäroten missgynnas av det moderna skogsbruket och minskar nu starkt.