Veksäven förekommer på tidvis översvämmad, gärna lerig mark vid näringsrika sjö- och åstränder, från högvattenlinjen ned till några decimeters djup. Den förekommer också ofta på vassrika gungflyn. I ytterskärgården är den vanlig i hällkar. Veksäven koloniserar dessutom ofta nygrävda, tidvis vattenfyllda vägdiken och dammar, särskilt nygrävda viltvatten.