Gårdsskräppa vill ha kväverik mark och inte alltför slutet växttäcke. Man ser den sticka upp kring gårdarna nära gödselhögar eller på ytor påverkade av gödselvatten, gärna på trampad mark, i diken och kring ladugårdar och hagar, jaler. Ute på fälten kan den vara vanlig i nya lägdor, i trädesåkrar och i beten (arten brukar inte betas), helst på friskare mark. Den kan även uppträda som ogräs i trädgårdar, potatisland och planteringar. Arten är också vanlig på jordhögar, utfyllnadsmassor, skräphögar och annan ruderatmark i tätorterna. Den kan följa nygjorda skogsbilvägar på uppkast och växer ibland t.o.m. i traktorspår på hyggen. Gårdsskräppan har dessutom infunnit sig på kulturpåverkade och reglerade stränder. Förekomsterna på driftvallar och fågelskär vid havet är möjligen mer ursprungliga.