Jämtlandsmaskros är den enda norrländska representanten för denna i övrigt sydliga sektion. Om man bortser från en lokal i Norge, där den troligen är utgången, och en lokal i Finland, så är den endemisk för centrala Norrland; dess utbredning följer i stort Jämtlands kambrosilurområde.
Hos oss växer den – eller har vuxit – i den mellangeolitorala zonen längs de stora vattendragen, främst Ljungan. Endast en gång är den noterad från en större skogsbäck – Lombäcken i Borgsjö. Den är mycket kalkkrävande, inskränkt till rika stränder och vill där växa solöppet i relativt gles vegetation på en fast mineralstrand av sediment eller morän. Den tycks vara mycket känslig för regleringar och är nog den växt som lidit mest skada av utbyggnaden av vattenkraft i Ljungan. Försurning och urlakning är sannolikt också bidragande orsaker till dess tillbakagång.