Agnsäven är flerårig. Den förökar sig lokalt med underjordiska utlöpare och blir ofta beståndsbildande. Arten är ljuskrävande och ganska näringskrävande. Agnsäv är en av havsstrandens karaktärsarter, knuten till finsediment-stränder i botten av havsvikar och fjärdar. Den kan här bilda en egen zon, agnsävbältet, i strandens nedre del. Det är utbildat kring vatten-linjen vilket innebär att växten ömsom står i vatten, ömsom på land. Den förekommer även på skyddade moränstränder men den är löst rotad och tål ingen kraftigare exponering. I mer exponerade delar av skärgården återfinns agnsäven ofta i hällkar eller kring isolerade gölar en bit upp på stranden. Arten förekommer också vid sötvatten, i liknande miljöer som knappsäv. Vid Dalälven växer den på grunt vatten vid stränderna till fjärdar och dammar – ofta i gles strandvegetation med något dyiga bottnar. Enstaka fynd har också gjorts vid vattensamlingar kring svackor i skogen, i diken och i grustag.

Vissa inlandsfynd kan vara förväxlingar med knappsäv men vid Dalälven är växten snarast något förbisedd. Den är också känd från detta område sedan tidigare.
Vanlig (17% och 145 noterade lokaler). Efter kusten mycket vanlig (96% av kustrutorna).