Bitterpilörten är en konkurrenssvag och lerälskande ört med höga krav på ljus- och näringstillgång. Arten är ettårig och fröföryngrad. Den finns främst vid näringsrika sjöar och vattendrag. Bitterpilörten växer ofta på naken lerjord längs öppna diken, i fuktiga nötta betesmarker, längs leriga stränder eller i blöta svackor i åkrar. Ibland uppträder den som vattenväxt på grunt vatten där konkurrensen från annan vattenvegetation är liten.

Bitterpilörten är vanligast kring den näringsrika centrala odlingsbygden längs Gavleån och Dalälven.
Mindre vanlig (17% och 48 lokaler). Minskande.