Klubbstarr är en ursprunglig art. Den är kalkgynnad och växer på öppen fuktig mark. Arten är vanlig i extremrikkärr och kan växa på både fastmattor och gungfly. Klubbstarren förekommer även sparsamt i intermediära kärr, ofta i högstarr-pors-blåtåtel-samhällen. Den har också en stark dragning åt stränder vid rinnande vatten där den framför allt växer i strandnära fuktängar och kärr men även på fasta morän-stränder vid strömmande vatten. Klubbstarren är sannolikt något slåttergynnad och förekomster i fuktängsmiljöer vid sjöar och vattendrag kan vara rester från en större utbredning under ängsbruket. Arten kan även förekomma i friska gräsmarker på mineraljord i strandanknutna ekosystem och får då en mer kompakt hållning.

Bara underarten vanlig klubbstarr, ssp. buxbaumii, är känd från landskapet.

Mindre vanlig (25% och 135 noterade lokaler).