Klapperögontröst förekommer regelbundet längs den yttre havsstranden där den ingår i standzoneringen. Den växer främst på moränstränder, ibland även på grova, blockiga, utsatta stränder. Den ses mellan stenar i gles, lågvuxen vegetation på strandens mellersta del, ibland på grus och sand; i Tynderö är den dessutom sedd i klippspringor. Där den finns uppträder den ofta i stor mängd.
Klapperögontröst E. frigida var. baltica är ännu inte formellt beskriven. Den är dock geografiskt, ekologiskt och morfologiskt väl avgränsad.