Svartfryle har en naturlig hemvist i våra rikare myrar. Mest typiskt förekommer den i rikkärren, där den växer i artrika tuvkanter. Av och till ses den även i medelrika myrar, där den växer i högre fastmattor, gärna i anslutning till flöden. Dessutom kan den påträffas på mosskuddar i sluttande källmyrar. Arten gynnas av störningar och ses inte sällan i körspår och gamla basvägar på myrar. Sin största förekomst har den idag längs skogsbilvägar, körvägar, traktorspår och stigar, gärna i mer eller mindre källpåverkade diken men lika ofta helt torrt, i gruset intill körbanan.