Vårspärgel är starkt specialiserad på hällmarker dels uppe på bergstoppar, dels i hällmarkstallskog nära havet. Den växer i bergssprickor och på små jordfläckar i den mycket magra och sura miljön bland renlav, kruståtel Deschampsia flexuosa, rödven Agrostis capillaris m.fl. Arten är annuell och beroende av viss erosion i jordtäcket för sin groning på hösten. Populationerna är vanligen små och växlar mycket i storlek mellan olika år. Vårspärgel förekommer i samma miljö som bergglim Atocion rupestre men är mer klimatiskt bunden till kusten; särskilt vanlig är den på bergen i Njurunda. Sina utposter har den knappt två mil från havet i väster på Ängomsåsen i Tuna och på Lövbergsåsen i Ljustorp . Den anmärkningsvärda luckan på de rikare bergen och hällarna kring Klingerfjärden tyder på att arten är kalkskyende.