Bergdunört är ursprunglig men kulturgynnad. Den växer enstaka eller i små grupper i rasbranter, ganska glesa lövskogar, lövdungar samt träd- och buskridåer. Dessutom finner man den på kulturpåverkade, mer eller mindre beskuggade ståndorter - hagmarker, väg- och åkerrenar, dikeskanter, banvallar, grustagsslänter samt snår och häckar vid bebyggelse.