Av fläcknycklarnas båda underarter är skogsnycklar den äldre. Jungfru Marie nycklar har uppkommit ur skogsnycklar genom att antalet kromosomer har fördubblats. En sådan fördubbling behöver inte alltid leda till ett annat utseende, men så har det gått i detta fall. I genomsnitt är skogsnycklar större, med mer rundtoppade basala blad, svagare fläckighet, mörkare blommor och blommor med tydligare trekluven läpp. Blommornas utseende varierar mer än på jungfru Marie nycklar och mer än på andra orkidéarter, både till form och färg. Skillnaden mellan underarterna är dock inte så skarp att det går att sätta namn på alla exemplar man finner.

Se även skogsnycklar Dactylorhiza maculata subsp. fuchsii och Jungfru Marie nycklar Dactylorhiza maculata subsp. maculata