Toppdån växer på frisk till fuktig, kväverik mark kring gårdar, i åkerkanter, på trädor, intill gödselstäder och ladugårdar, i gödslade betesmarker samt i rasmarker med gles lövskog och på hyggen, men även på utfyllnader och jordhögar. Dessutom är toppdån vanlig på tånggödslade havsstränder tillsammans med snärjmåra och krusskräppa.