Brunrör växer i fuktig skogsmark, sumpskog och kärrkanter. Gräset förekommer dessutom ofta i vägkanter och diken i skogstrakter samt i igenväxande våta marker, där det kan bilda stora bestånd. Arten har ökat starkt sedan förra inventeringen, troligen gynnad av upphörd hävd och möjligen också av kvävenedfall.