Kärrbräken växer halvskuggigt till skuggigt, oftast på basrik jord, i näringsrika våtmarker som alkärr, andra skogskärr och sumpskogar, igenväxande fuktängar, utefter bäckar och gölar samt på kärrartade sjöstränder. Vi har återfunnit den på cirka hälften av de gamla lokalerna och gjort lika många nyfynd. Så länge biotopen inte förändras tycks arten vara stabil på sina växtplatser.