Hästskräppa växer på blöt till fuktig, näringsrik mark i och intill sötvatten på sjöstränder, längs åar, bäckar och diken, i fuktängar och alkärr. Arten har två utbredningsområden i Bohuslän, dels längs Göta och Nordre älvar där den är vanlig, dels kring Strömsvattnet i Strömstads kommun. Under vår inventering har tillkommit några lokaler mellan dessa områden.